En 2001 se inscribe en la Primera B donde compite hasta 2004, equipacion dinamarca 2022 temporada en la que gana el Torneo Reducido y obtiene el segundo ascenso a camiseta de francia Primera División. Comenzó a competir en el primer campeonato en 1986 y continuó en la categoría hasta 1989. Entre 1990 y 2000 estuvo retirado del certamen. Independiente es uno de los clubes fundacionales de la Primera División de futsal argentino y actualmente compite en la categoría.
